成立于2012年3月，经过十多年来的不断发展，现科室有开放床位45张,配有医护人员24人（医生7人，护士17人）其中副主任医师1人，主治医师3人)，
科室配有：中心供氧，小儿 CPAP 系列持续正压通气系统，多参数监护仪，婴儿辐射保暖台，微量注射泵，婴幼儿经皮黄疸测试仪，新生儿暖箱，振动排痰仪，肺炎腹泻治疗仪，智能雾化室等设备。
汉源县中医医院儿科是运用中西医结合诊治儿童内科疾病的综合性科室。目前开展新生儿疾病如新生儿病理性黄疸、新生儿感染性疾病、早产儿等疾病的诊断治疗。儿童的呼吸系统疾病如毛细支气管炎、肺炎、重症肺炎、支气管哮喘；儿童的消化系统常见病如呕吐、腹痛、急性肠系膜淋巴结炎、急性肠炎；感染性疾病如手足口病、水痘、带状疱疹、病毒性心肌炎、脓毒血症等疾病的治疗。熟练掌握对于新生儿及儿童的急救，如新生儿复苏、儿童心肺复苏、急性心衰、急性呼吸衰竭、休克、高热惊厥、其他急性中毒性疾病的急诊处理；开展穴位贴敷治疗（咽扁贴、咳嗽贴、腹痛贴、厌食贴），耳穴压豆，灸法，中药塌渍治疗，中药涂擦治疗，小儿推拿等中医特色治疗。